复旦提出生命算子,迈向全尺度生命建模

复旦团队发布生命算子框架,将生命视为多尺度动力系统,通过感知、演化、生成三类算子及尺度桥实现跨尺度统一建模,已有6篇Nature系列论文支撑,并落地心脏虚拟临床项目。
从虚拟细胞到全尺度生命推演
近年来,AI与生物学的交叉领域迎来一个热门方向——虚拟细胞(AIVC)。去年6月,Arc Institute发起的虚拟细胞挑战赛吸引了全球114个国家5000多名研究者参与;今年第二届赛事刚开赛一周,报名人数已突破2500人。其核心设想是:能否在计算机中“培养”出一个细胞,用它替代部分真实实验?
然而,人体并非单细胞堆砌。药物进入体内后,会依次影响分子通路、细胞状态、组织微环境,最终传导至器官功能,才表现为CT影像或临床症状。这意味着,生命是一个从细胞到器官层层耦合的多尺度系统。当前多数模型各自为政:单细胞模型、蛋白模型、器官数字孪生彼此割裂,难以真正模拟整体生命过程。
生命算子:把生命数学化
针对这一难题,复旦大学上海医学院王烁团队与香港科技大学郭毅可教授合作,于近日发布预印本论文,提出“生命算子”(Life Operators)框架。其核心思路并非构建更大的模型,而是先将生命计算拆解为可组合的基础单元。
在该框架中,生命被视为一个开放、随机、受控且部分可观测的多尺度动力系统。我们观察到的CT、基因表达等数据,只是生命内部状态的“投影”。要推演生命,需回答三个问题:当前状态如何?未来如何变化?变化后会产生什么观测信号?
为此,团队设计了三类算子:
- 感知算子:从影像、组学、病历等外部观测中反推系统真实状态。
- 演化算子:模拟疾病自然发展或干预后的变化,回答“如果这样做会怎样”。
- 生成算子:根据预测状态生成对应的影像、波形等可观测结果。
这三类算子形成闭环,并可依据新数据持续校准。更关键的是,团队引入了尺度桥机制,作为不同尺度模型间的“翻译器”。细胞模型只需传递器官模型所需的信息(如材料参数、边界条件),器官层面的压力、药物暴露也能反馈回细胞层。这样,不同尺度的模型首次有望真正衔接,组装成一张“生命算子图”。
不过,这张图并非越大越好。针对具体问题(如预测心脏器械效果),系统只调用必要尺度,避免过度计算。算子还具备“证据驱动的自进化”能力:新数据出现后,AI可提出新算子版本,经独立数据或真实实验验证后升级或淘汰,确保模型不偏离科学规律。
六年积累:从内镜到心脏的实证
生命算子并非纸上谈兵。过去数年间,王烁团队已在多个领域积累了技术基础:
- 消化内镜:开发EndoKED系统,利用约100万张多中心内镜图像,结合大语言模型与视觉模型,实现自动知识提取和像素级标注,发表于《自然·生物医学工程》。
- 肾癌影像:2025-2026年连续发表论文,其中专病基础模型RenalCLIP覆盖8809名患者、27866次CT扫描,可同时完成解剖评估、诊断和预后分析。
- 心脏建模:参与研发的MeshHeart模型(2025年发表于《自然·机器智能》),将三维心脏压缩至潜在状态空间,学习个体化运动演化,从静态识别走向动态推演。
这些成果对应了感知、演化、生成三类算子,但过去散落于不同论文。现在,团队将其整合为可复用的“生命算子库”,使科研成果从“论文资产”转化为“计算资产”。
从力学方程到生命方程
王烁的研究之路始于2010年保送复旦大学理论与应用力学专业,后赴剑桥大学攻读放射学博士,研究心血管系统。在帝国理工期间,他与郭毅可教授合作,将机理建模与数据驱动结合,最终于2021年回国组建NeoLab团队。
生命算子的首个落地场景选择了心脏。2025年,王烁在复旦孵化支持下成立上海全晓得医疗科技有限公司,启动Cardio-World项目。心脏是天然的跨尺度系统:从细胞电活动到心肌收缩、泵血,再到血流动力学和临床结局,环环相扣。团队正将既往心脏模型重构为算子模块,目标是构建能回答干预问题的计算系统,例如预测药物效果或器械植入后的变化。其近期方向是“虚拟临床”——先在计算机中筛选不合适的参数,缩小动物实验和临床试验范围,提高成功率。
目前,Cardio-World已完成底层框架和核心算子原型开发。若进展顺利,未来可能实现“一人一药”的个性化医疗设计。